GenomeMedicine宏基因

黑色素瘤，由黑色素细胞恶变而来的一种高度恶性的肿瘤，简称恶黑。恶性黑色素瘤多发生于皮肤，也可发生于黏膜（包括内脏黏膜）、眼葡萄膜、软脑膜等部位。我国人群好发于肢端皮肤（足底、足趾、手指末端和甲下等部位）。恶性黑色素瘤的病因尚未完全清楚。一般认为是多方面的，种族与遗传、创伤与刺激、日光、免疫等因素均可能相关。危险因素包括：肤色白皙、有多发色素痣（尤其掌跖等易受摩擦部位）或发育不良痣、长期紫外线暴露或日晒史、有黑色素瘤家族史或既往曾有黑色素瘤病史等。

Relatingthegutmetagenomeandmetatranscriptometoimmunotherapyresponsesinmelanomapatients

GenomeMed(IF:10.;Q1)

10./s---4

2年10月9日

JiyoungAhn

纽约大学Perlmutter癌症中心

最近的证据表明，肠道菌群可调节黑色素瘤的免疫治疗效果。在人类检查中很少有研究这种现象，而且还没有宏转录组学数据，这对于确定宏基因组功能在微生物群落中的表达至关重要。

16SrRNA基因分析，宏基因组以及宏转录组。

较高的微生物群落丰富度与16S和宏基因组数据中较长的PFS相关（p?0.05）。基于总体微生物组组成的聚类将患者分为三组，每组具有不同的PFS。在随访期间，低风险组的发展风险比高风险组低99％（p?=0.）。在回归分析选择的物种之间，丰富Bacteroidesovatus,Bacteroidesdorei,Bacteroidesmassiliensis,Ruminococcusgnavus,和Blautia产物可缩短短PFS，Faecalibacteriumprausnitzii,Coprococcuseutactus,Prevotellastercorea,Streptococcussanguinis,Streptococcusanginosus,和LachnospiraceaebacteriumFAA可延长PFS。宏基因与PFS相关的功能,与宏转录组中基因表达一致，包括风险相关的通路L-鼠李糖降解，鸟苷核酸的生物合成，和B族维生素的生物合成。

Fig.1Patientclustersbasedonoverallmicrobiome

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